Os jutsus são uma das principais características da build de um Shinobi.
Eles são as habilidades que estão disponíveis. O jogador pode acessar a janela de skills pelo comando Alt+S.
Os jutsus podem ser obtidos dentro da academia, e o requisito para obter um jutsu é completar sua missão e para obter a missão será necessário falar com o NPC do Treino dos jutsus desejados. Somente pode obter a missão caso você já tenha algum treino no nível do jutsu (Básico, Intermediário ou avançado).
Ao aprender um jutsu ele terá sua força com base no nível do treino sendo de 1 a 4, onde 1 seria ao não ter o treino e 4 quando o treinamento estiver no nível avançado. Dessa forma, não é necessário ter o treino específico para escolher o jutsu dele, ele somente será mais fraco caso não o tenha.
Lista de Jutsus